Protein–RNA interactions for Protein: P02462

COL4A1, Collagen alpha-1(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A1P02462 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COL4A1P02462 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms