Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CFDP00746 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CFDP00746 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CFDP00746 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CFDP00746 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms