Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SIN3BO75182 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SIN3BO75182 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms