Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PPFIA3O75145 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PPFIA3O75145 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms