Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
ABCC9O60706 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
ABCC9O60706 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms