Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SMARCA5O60264 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMARCA5O60264 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms