Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SYNGR2O43760 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SYNGR2O43760 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SYNGR2O43760 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SYNGR2O43760 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms