Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SPRY3O43610 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPRY3O43610 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms