Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SEMA3EO15041 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms