Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CLGNO14967 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CLGNO14967 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CLGNO14967 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CLGNO14967 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms