Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GOLIM4O00461 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GOLIM4O00461 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms