Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF879B4DU55 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ZNF879B4DU55 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms