Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LINC00587B1AMM8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms