Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NCBP2LA6PVI3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NCBP2LA6PVI3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms