Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RGPD3A6NKT7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD3A6NKT7 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms