Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
IRGMA1A4Y4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms