Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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TRAV26-1A0A087WT03 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRAV26-1A0A087WT03 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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