Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
U3KQ87 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
U3KQ87 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
U3KQ87 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
U3KQ87 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
U3KQ87 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms