Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC61Q9Y6R9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC61Q9Y6R9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms