Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COG6Q9Y2V7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COG6Q9Y2V7 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms