Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NINLQ9Y2I6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NINLQ9Y2I6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms