Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVW-1Q9UQF0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms