Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK1Q9UPV9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TRAK1Q9UPV9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms