Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
USP18Q9UMW8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
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