Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FZD4Q9ULV1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms