Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG6

CCPG1, Cell cycle progression protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCPG1Q9ULG6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCPG1Q9ULG6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms