Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DENND2AQ9ULE3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DENND2AQ9ULE3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms