Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEFF2Q9UIK5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms