Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ABCF2Q9UG63 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ABCF2Q9UG63 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms