Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
DUX4Q9UBX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms