Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM8A1Q9UBU6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM8A1Q9UBU6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms