Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DPM3Q9P2X0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms