Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC88CQ9P219 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC88CQ9P219 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms