Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TVP23BQ9NYZ1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms