Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRMT1Q9NXH9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms