Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
POLR3EQ9NVU0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLR3EQ9NVU0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms