Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FBXO28Q9NVF7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms