Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJB4Q9NTQ9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms