Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LRRC4BQ9NT99 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms