Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PNPLA3Q9NST1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PNPLA3Q9NST1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms