Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNNM1Q9NRU3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNNM1Q9NRU3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms