Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TULP4Q9NRJ4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TULP4Q9NRJ4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms