Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FZD3Q9NPG1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms