Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RAB18Q9NP72 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RAB18Q9NP72 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms