Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CLSPNQ9HAW4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLSPNQ9HAW4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms