Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00574Q9H8X3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms