Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NBPF3Q9H094 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NBPF3Q9H094 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms