Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZL8

BPESC1, Putative BPES syndrome breakpoint region protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPESC1Q9GZL8 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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BPESC1Q9GZL8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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BPESC1Q9GZL8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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BPESC1Q9GZL8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BPESC1Q9GZL8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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