Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CEP44Q9C0F1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CEP44Q9C0F1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms