Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMIM3Q9BZL3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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